RFLP: Resriction Fragmentation Lenght Polymorphism تکنیکی با استفاده از آنزیم های محدود کننده بر روی محصول تولید شده توسط PCR میباشد. آنزیم های محدود کننده بر اساس نوع توالی که میتوانند شناسایی نمایند قطعه DNA مورد استفاده را در همان مناطقی که داری توالی قابل شناسایی آنزیم میباشد برش داده و در نتیجه قطعه DNA را بر حسب تعداد برش به چندین تکه با سایزهای متفاوت تبدیل میکند که در مراحل بعدی به وسبله الکتروفورز بر روی ژل اگارز 3-2 درصد تعداد این قطعات و همچنین سایز انها قابل مشاهده میشود. از RFLP در تعیین گونه و نقشه برداری ژنتیکی ،پزشکی قانونی به همراه VNTR کاربرد دارد.
VNTR (تکرار متناوب از شماره های متغیر ) در واقع ردیفی کوتاه از چند نوکلئوتید با تکرار متناوب بر روی یک کروموزوم میباشد که بر روی کروموزوم های متفاوت وجود داشته و دارای طولی متغیر در بین افراد مختلف میباشد که از این تفاوت میتوان در بررسی های ژنتیکی در پزشکی قانونی، انگشت نگاری ژنتیکی و همچنین در تعیین والدین استفاده نمود.
در شکل شماتیک بالا بلوکهای مستطیلی نشان دهنده مناطق VNTR بوده و خطوط ضخیم نواحی عادی را نشان میدهد. این نواحی امکان برش مناطق VNTR را توسط آنزیم های محدود کننده و استخراج این نواحی را جهت تکثیر توسط PCR و یا بررسی های بیشتر توسط RFLP فراهم میسازد. در واقع این مناطق توسط PCR و متدهای RFLP تکثیر شده و سپس از طریق الکتروفورز بر روی ژل تعیین سایز میشود که بر حسب تفاوتهای فردی الگوی متغیر سایزی را نشان میدهد.
VNTR (تکرار متناوب از شماره های متغیر ) در واقع ردیفی کوتاه از چند نوکلئوتید با تکرار متناوب بر روی یک کروموزوم میباشد که بر روی کروموزوم های متفاوت وجود داشته و دارای طولی متغیر در بین افراد مختلف میباشد که از این تفاوت میتوان در بررسی های ژنتیکی در پزشکی قانونی، انگشت نگاری ژنتیکی و همچنین در تعیین والدین استفاده نمود.
در شکل شماتیک بالا بلوکهای مستطیلی نشان دهنده مناطق VNTR بوده و خطوط ضخیم نواحی عادی را نشان میدهد. این نواحی امکان برش مناطق VNTR را توسط آنزیم های محدود کننده و استخراج این نواحی را جهت تکثیر توسط PCR و یا بررسی های بیشتر توسط RFLP فراهم میسازد. در واقع این مناطق توسط PCR و متدهای RFLP تکثیر شده و سپس از طریق الکتروفورز بر روی ژل تعیین سایز میشود که بر حسب تفاوتهای فردی الگوی متغیر سایزی را نشان میدهد.