شيخ کلینی دانشمندی پرآوازهتولددر یکی از روز های زیبای خدا ، در قریه ای از توابع " ری " ، خانه ی یعقوب کلینی به نور تولد نوزادی پاک ، روشن شد . نوزادی که بعد ها او را " شیخ کلینی " نامیدند
.
پدرش به خاطر ارادتی که به رسول گرامی اسلام ، حضرت محمد ( صلی الله علیه و آله ) داشت ، او را محمد نامید و از آن پس محمد ابن یعقوب کلینی ، در خانه ای که معنویت در آن موج می زد ، تحت تربیت قرار گرفت.
پدر او فاضلی عالم و زاهدی متقی بود که در قریه ی کلین همه او را به ایمان و دیانت می شناختند . مادرش نیز عالمه ای مطهره ، از خاندانی ربانی و دانشمندانی بزرگ بود