هرفتوسیستم ازتعدادی زیرواحد(جزء)تشکیل شده است.مولکول های تشکیل دهنده هرزیرواحدعبارتنداز:تعدادی مولکول کلروفیل کمین یااصلی(مولکول هایی که درنتیجه تابش پرتوهایک الکترون ازانها برانگیخته شده ودرزنجیره انتقال الکترون قرارمی گیرد)رنگیزه های کمکی(رنگیزه هایی که بادریافت نور الکترون خودراازدست نمی دهندبلکه انرژی دریافتی رابه مولکول کمین هدایت کرده تادرانتقال الکترون مورداستفاده قرارگیرد.یک مولکول دهنده الکترون ویک مولکول گیرنده الکترون(پذیرنده ی الکترون)درطرفین هرمولکول کمین وبالاخره مولکول های پروتئین زمینه که اسکلت زیرواحدهاراتشکیل می دهندوپایداری رنگیزه ها بسته به وجود انهاست.درPSIمولکول کمین عبارتست از کلروفیل aجذب کننده طول موج 700نانومترورنگیزه های کمکی عبارتندازحدود200تا400مولکول کلروفیل های aشامل 662692.684.677.670.chla. کلروفیل bوحدود50مولکول کاروتنوئیدها.
مولکول دهنده دران پلاستوسیانین PC))ومولکول گیرنده ی الکترون ماده X(پروتئین اهن-گوگرد)است.درPSIIمولکول کمین رامولکول کلروفیلaدارای طول موج جذبی درناحیه 680نانومتر تشکیل می دهدورنگیزه های کمکی عبارتنداز:حدود200مولکول کلروفیل های aشامل 662chla677.670 کاروتنوئیدها وکلروفیل b.مولکول دهنده الکترون دران ماده z(به احتمال نوعی کلروفیل a)ومولکول گیرنده الکترون Yیافئوفتین می باشدکه دارای ساختمان 4پیرولی بازواغلب وابسته به پروتئین هامی باشد.(مثل فیکواریترین.فیکوسیانین)
مولکول دهنده دران پلاستوسیانین PC))ومولکول گیرنده ی الکترون ماده X(پروتئین اهن-گوگرد)است.درPSIIمولکول کمین رامولکول کلروفیلaدارای طول موج جذبی درناحیه 680نانومتر تشکیل می دهدورنگیزه های کمکی عبارتنداز:حدود200مولکول کلروفیل های aشامل 662chla677.670 کاروتنوئیدها وکلروفیل b.مولکول دهنده الکترون دران ماده z(به احتمال نوعی کلروفیل a)ومولکول گیرنده الکترون Yیافئوفتین می باشدکه دارای ساختمان 4پیرولی بازواغلب وابسته به پروتئین هامی باشد.(مثل فیکواریترین.فیکوسیانین)
