آنزیم Leucine Aminopeptidase (LAP)

rahgozar_0`1

عضو جدید
1 معرفی Leucine Aminopeptidase و سویسترای مربوطه

Leucyl aminopeptidases یا ) LAP ( آنزیمی است که ترجیحا هیدرولیز لوسین در N-terminal پپتیدها و پروتئین ها را تسریع کند . با این حال می تواند سایر N-terminal های باقی مانده را نیز جدا می کند . به دلیل نقش آنها در تخریب پروتئین از اهمیت حیاتی بیولوژیکی برخوردار است .
 

rahgozar_0`1

عضو جدید
2. مشخصات ساختاری
آنزیم LAP لنز گاو وزن مولکولی 324.000 نشان داد . این آنزیم شامل دو یون روی و 487 اسید آمینه است . ساختار کلی LAP به شکل هگزامر ( hexamer ) با تقارن D3 است . domain مربوط به N-terminal با رنگ آبی و domain مربوط به C-terminal با رنگ سبز مشاهده می شود و یونهای روی کاتالیزوری که به رنگ زرد نشان داده شده است و مارپبچ نارنجی رنگ این domain ها را به هم متصل کرده است .
1.jpg
 

rahgozar_0`1

عضو جدید
3 اکتیوسایت
اکتیو سایت شامل دو یون روی که با فاصله 0.3 نانومتر از هم جدا هستند . در این آنزیم هر یون روی 5 کوردینه است . دو یون روی توسط پل های Glu 334 ، Asp 255 و مولکول آب به یکدیگر متصل شده اند . دیگر لیگاند های
متصل به روی عبارتند از : Asp 332 )اتصال از طریق گروه کربنیل و کربوکسیلات ( متصل به Zn1 و Lys 250 و Asp 273 متصل به Zn2 .
2.jpg
 

rahgozar_0`1

عضو جدید
4. مکانیسم

در مکانیسم پیشنهاد شده ، واکنش دهنده (I) ، سوبسترا با گروه آمین N-terminal خود به Zn2 و با گروه کربونیل خود به Zn1 متصل می شود . در مرحله دوم گروه بی کربنات به عنوان باز یک پروتون از آب جدا می کند و یون هیدروکسید تشکیل شده یک حمله هسته دوستی به C1 انجام می دهد و حدواسط (II) را تشکیل می دهد. این آنزیم به دو یون Zn2 + به منظور فعال ساختن مولکول آب کاتالیستی نیاز دارد . در II ، یون Zn1 با کوردینه شدن با اتم اکسیژن (O3) از کربونیل (C1 = O3) گروه سوبسترا ، پیوند پپتیدی را فعال می کند . در مرحله نهایی، یون بی کربنات به عنوان اسید که پروتونی را قبلا به دست آورد را به به اتم نیتروژن پپتید اهدا می کند و باعث قطع شدن پیوند آمید می شود .

Capture.jpg
 
Similar threads
Thread starter عنوان تالار پاسخ ها تاریخ
rahgozar_0`1 آنزیم Carboxypeptidase A شیمی معدنی 3

Similar threads

بالا